Rolą Kolegium Programowego jest określenie założeń i kierunków działań wystawienniczych i merytorycznych w Muzeum Okręgowym w Toruniu. Powołane w 2010, na czas nieokreślony, składa się wyłącznie z pracowników Muzeum. Zmiany w jego składzie lub zaprzestanie jego działalności wprowadzane są tylko i wyłącznie Zarządzenie Dyrektora Muzeum.
Mierzejewska Aleksandra – p.o. dyrektora Muzeum Okręgowego w Toruniu
Bokiniec Ewa – kustosz dyplomowany
Kłosiński Michał – kustosz
Kroplewska-Gajewska Anna – starszy kustosz
Markowska Iwona – adiunkt muzealny
Matella Justyna – adiunkt muzealny
Mierzejewska Aleksandra – starszy kustosz/wicedyrektor ds. naukowych
Nierzwicka Magdalena – kustosz
Stefańska Alina – kustosz
Smolarek Hubert – starzy referent