Muzeum Okręgowe w Toruniu znalazło się w gronie 10. najchętniej odwiedzanych muzeów w Polsce. Z liczbą odwiedzających sięgającą rocznie 400 tysięcy uplasowało się na 10. miejscu jako jedynaw tym zestawieniu samorządowa instytucja kultury tego typu.
Na szczycie listy opublikowanej przez Główny Urząd Statystyczny znalazło się Muzeum Pałacu Króla Jana III w Wilanowie przed Muzeum Łazienki Królewskie i Państwowym Muzeum Auschwitz-Birkenau w Oświęcimiu.
Muzeum Okręgowe w Toruniu okazało się również bezkonkurencyjne na tle województwa kujawsko-pomorskiego. Łącznie 40 muzeów i oddziałów muzealnych w tym regionie odwiedziło w zeszłym roku 1,2 mln gości. Oznacza to, że toruńska instytucja ze swoimi sześcioma filiami (Ratusz Staromiejski, Muzeum Podróżników im. Tony’ego Halika, Muzeum Sztuki Dalekiego Wschodu w Kamienicy pod Gwiazdą, Dom Mikołaja Kopernika oraz Muzeum Toruńskiego Piernika) wygenerowała 1/3 z nich.
Lista najchętniej odwiedzanych muzeów w Polsce w roku 2016:
1. Muzeum Pałacu Króla Jana III w Wilanowie
2. Muzeum Łazienki Królewskie
3. Państwowe Muzeum Auschwitz-Birkenau w Oświęcimiu
4. Zamek Królewski na Wawelu
5. Muzeum Żup Krakowskich w Wieliczce
6. Zamek Królewski w Warszawie
7. Muzeum Historii Żydów Polskich POLIN w Warszawie
8. Muzeum Powstania Warszawskiego w Warszawie
9. Muzeum Zamkowe w Malborku
10. Muzeum Okręgowe w Toruniu